Rekombinante Virusvarianten

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XD handelt es sich um die Kombination aus der Delta- (Subvariante AY.4) und der Omikron-Variante (Subvariante BA.1). Das S-Gen von BA.1 wurde in das Genom von AY-4 aufgenommen. ^[5,30]

Weitere charakteristische Mutationen:

NSP2: E172D ^[24]

Vorkommen und Verbreitung:

Bisher wurden 25 Sequenzierungsergebnisse in drei Ländern nachgewiesen, die meisten davon in Frankreich ^[31]. In Deutschland wurde ein Nachweis gemeldet. ^[5]

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XD konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XE handelt es sich um die Kombination aus der BA.1- (NSP1-6) und der BA.2-Variante. Zusätzlich besitzt XE folgende Mutationen, die nicht in BA.1 und BA.2 auftreten. ^[24]

Weitere charakteristische Mutationen:

NSP3 V1069I, C3241T, NSP12 C14599T ^[24]

Vorkommen und Verbreitung:

Die Rekombinante XE wurde vor allem in UK nachgewiesen ^[24]. Bis zum 06.05.2022 wurden 2.035 Sequenzierungsergebnisse weltweit nachgewiesen, dabei wurde die Variante in 21 Ländern und 25 US-Bundesstaaten gemeldet ^[32]. In Deutschland wurden 18 Nachweise gemeldet ^[5].

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XE konnte noch kein vollständiges Risikoprofil erstellt werden. Beim Vergleich der Wachstumsrate der XE- und der BA-2-Variante wurden keine Unterschiede festgestellt. ^[24]

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XF handelt es sich um die Kombination aus der Delta- und der Omikron-Subvariante BA.1 mit einem Bruchpunkt beim Nukleotid 5.386 (NSP3) ^[33].

Weitere charakteristische Mutationen:

/

Vorkommen und Verbreitung:

Von der Rekombinanten XF wurden 33 Sequenzierungsergebnisse (25.05.2022) in UK nachgewiesen ^[34].

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XF konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XG handelt es sich um die Kombination aus der BA.1- und der BA.2-Omikron-Subvariante mit einem Bruchpunkt zwischen den Nukleotiden 5.927 und 6.511 (NSP3) ^[35].

Weitere charakteristische Mutationen:

/

Vorkommen und Verbreitung:

In Deutschland wurden bis zum 18.05.2022 drei Sequenzen nachgewiesen ^[5]. XG wurde auch in Dänemark, UK, Spanien und in den USA nachgewiesen ^[36]. Insgesamt wurden 204 Sequenzierungsergebnisse dieser Rekombinante nachgewiesen ^[36].

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XG konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

XH ist eine rekombinante Variante aus der BA.1 und der BA.2 ^[40].

Weitere charakteristische Mutationen:

/

Vorkommen und Verbreitung:

In Deutschland wurde diese Rekombinante bisher zweimal nachgewiesen ^[5]. Weiterhin wurde XH auch in 53 Fällen in Dänemark und einmal in UK nachgewiesen ^[37].

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XH konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XM handelt es sich um die Kombination aus der BA.1.1- und der BA.2-Omikron-Subvariante mit einem Bruchpunkt beim Nukleotid NSP13-15 ^[38].

Weitere charakteristische Mutationen:

/

Vorkommen und Verbreitung:

In Deutschland ist XM die am häufigsten vorkommende rekombinante Variante mit 273 detektierten Sequenzen (Stand: 25.05.2022). XM wurde Mitte Februar 2022 das erste Mal und seitdem in mehreren europäischen Ländern nachgewiesen, darunter Dänemark, Niederlande und UK. ^[5]

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XM konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

Genetische Eigenschaften und Charakterisierungen:

Bei XN handelt es sich um die Kombination aus der BA.1- und der BA.2-Omikron-Subvariante ^[39].

Weitere charakteristische Mutationen:

Del144/144 ^[40]

Vorkommen und Verbreitung:

In Deutschland wurde bis zum 18.05.2022 eine Sequenz nachgewiesen ^[5]. XN wurde zudem in 100 Fällen nachgewiesen, hauptsächlich in UK ^[39].

Risikoprofil:

Aufgrund der wenigen Sequenzierungsdaten zu XN konnte noch kein Risikoprofil erstellt werden.

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[26] outbreak.info, BA.4 Lineage Report; outbreak.info (zuletzt aufgerufen am 25.05.2022)

[27] outbreak.info, BA.5 Lineage Report; outbreak.info (letztmalig aufgerufen am 25.05.2022)

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[29] github - cov-lineages, issues 444 (letztmalig aufgerufen am 28.04.2022)

[30] Colon P., et al., Culture and identification of a "Deltamicron" SARS-CoV-2 in a three cases cluster in southern France (2022), https://doi.org/10.1002/jmv.27789 (letztmaligaufgerufen am 18.05.2022)

[31] Cov-Lineages Lineage XD (letztmalig aufgerufen am 25.05.2022)

[32] outbreak.info XE Lineage Report (letztmalig aufgerufen am 25.05.2022)

[33] Public Health England. SARS-CoV-2 variants of concern and variants under investigation in England - Technical briefing 39 (2022) (letztmalig aufgerufen am 21.04.2022)

[34] Cov-Lineages XF Lineage (letztmalig aufgerufen am 25.05.2022)

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[36] Cov-Lineages XG Lineage (letztmalig aufgerufen am 25.05.2022)

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